深層蛀牙會經由醫師臨床檢查，確認牙髓組織的健康狀況來判斷是否有機會做活髓治療來保留牙髓活性。

但當患齒已有明顯症狀，如持續疼痛，腫脹發炎，甚至牙髓壞死、牙根尖膿腫，則建議直接進行根管治療，因為牙髓組織已經嚴重受損，活髓治療的效果不佳。